Возможность использования последовательностей rbcL и ITS2 для видовой идентификации мохообразных (на примере растений Антарктики)
WikiSysop (обсуждение | вклад) |
WikiSysop (обсуждение | вклад) |
||
| Строка 12: | Строка 12: | ||
[[Image:4moses in vitro 2013.jpg|300px|right]] | [[Image:4moses in vitro 2013.jpg|300px|right]] | ||
Материалом служили культивируемые in vitro растения Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Pohlia nutans (Hedw.) Lindb., Sanionia georgicouncinata (Müll. Hal.) Ochyra, Polytrichum juniperinum Hedw., которые выращивали на агаризованной среде МС (Murashige & Skoog, 1962) при +24°С и 16-часовом световом фотопериоде. Нативные образцы этих растений были собраны в 2009–2011 г.г. на антарктическом острове Галиндез и в оазисе Ширмахера (Земля Королевы Мод). Использовали описанные ранее пары праймеров для rbcL (Kress & Erickson, 2007) и ITS2 (Chiou et al., 2007). | Материалом служили культивируемые in vitro растения Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Pohlia nutans (Hedw.) Lindb., Sanionia georgicouncinata (Müll. Hal.) Ochyra, Polytrichum juniperinum Hedw., которые выращивали на агаризованной среде МС (Murashige & Skoog, 1962) при +24°С и 16-часовом световом фотопериоде. Нативные образцы этих растений были собраны в 2009–2011 г.г. на антарктическом острове Галиндез и в оазисе Ширмахера (Земля Королевы Мод). Использовали описанные ранее пары праймеров для rbcL (Kress & Erickson, 2007) и ITS2 (Chiou et al., 2007). | ||
| + | |||
| + | [[Image:DB Antarctica 2012.jpg|300px|left]] | ||
| + | Для хранения информации о коллекции антарктических растений была создана реляционная база данных (упрощенная ее структура приведена слева). В связанных таблицах хранятся сведения о точном месте сбора образцов, способах их видового определения, условиях культивирования и секвенирования, а также об экспериментах на устойчивость к абиотическим стрессам, проведенных с ними. | ||
Версия 18:32, 24 марта 2013
Возможность использования последовательностей некоторых ядерных и
хлоропластных генов для видовой идентификации мохообразных
(на примере растений Антарктики)
Дуплий В.П., Матвеева Н.А.
Институт клеточной биологии и генетической инженерии НАН Украины
ДНК-штрихкодирование является перспективным методом видовой идентификации живых организмов. Исследования в этом направлении были начаты около десяти лет назад работами П.Хеберта с соавторами. Сейчас большое внимание уделяется выяснению, какой именно участок ДНК может быть использован в качестве ДНК-штрихкода растений. Предлагаются различные участки ДНК, в частности, последовательности rbcL, matK, atpB-rbcL, trnL-trnF, rpoB, rpoC1, trnH-psbA, atpF-atpH (хлоропластная ДНК), а также ядерный спейсер ITS2. Мы попытались определить, могут ли последовательности rbcL и ITS2 быть использованы для видовой идентификации мохообразных.
Материалом служили культивируемые in vitro растения Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Pohlia nutans (Hedw.) Lindb., Sanionia georgicouncinata (Müll. Hal.) Ochyra, Polytrichum juniperinum Hedw., которые выращивали на агаризованной среде МС (Murashige & Skoog, 1962) при +24°С и 16-часовом световом фотопериоде. Нативные образцы этих растений были собраны в 2009–2011 г.г. на антарктическом острове Галиндез и в оазисе Ширмахера (Земля Королевы Мод). Использовали описанные ранее пары праймеров для rbcL (Kress & Erickson, 2007) и ITS2 (Chiou et al., 2007).
Для хранения информации о коллекции антарктических растений была создана реляционная база данных (упрощенная ее структура приведена слева). В связанных таблицах хранятся сведения о точном месте сбора образцов, способах их видового определения, условиях культивирования и секвенирования, а также об экспериментах на устойчивость к абиотическим стрессам, проведенных с ними.
