Лаборатория систем биосинтеза природных соединений
Sheludko (обсуждение | вклад) |
Sheludko (обсуждение | вклад) |
||
Строка 1: | Строка 1: | ||
===Лаборатория образована в 2009 году=== | ===Лаборатория образована в 2009 году=== | ||
<div style='margin-right:10px;float:left;width:450px;height:1420px;'> | <div style='margin-right:10px;float:left;width:450px;height:1420px;'> | ||
− | |||
− | |||
==Состав:== | ==Состав:== |
Версия 16:46, 24 июля 2016
Содержание |
Лаборатория образована в 2009 году
Состав:
с.н.с., к.б.н., с.н.с. Шелудько Юрий Всеволодович
н.с., к.б.н. Герасименко Ирина Михайловна
аспирант, инженер 1 кат.(1/2 ставки) Кирпа-Несмиян Татьяна Николаевна
Новости:
- 10.04.2015
Доклад Боровиковой К.С. "Определение содержимого хлорофиллов в листках транспластомных растений табака, экспрессирующих репортерный ген под контролем различных промоторов (Визначення вмісту хлорофілів в листках транспластомних рослин тютюну, які експресують репортерний ген під контролем різних промоторів), подготовленный в соавторстве с Клебанович А. и под руководством сотрудницы лаборатории систем биосинтеза природных соединений Герасименко И.М. награждён дипломом на XІIІ Международной научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых [<<ШЕВЧЕНКОВСКАЯ ВЕСНА 2015: БИОЛОГИЯ>>.
Данная работа заняла первое место на всеукраинком конкурсе научного творчества учащихся Intel Eco Ukraine національном етапе международного конкурса Intel International Science and Engineering Fair (Intel ISEF) в категории "Химическая и биологическая инженерия" и III место на Всеукраинском конкурсе Малой академии наук Украины.
- 17.04.2014
Доклад студентки КНУ Клебанович Анастасии Анатольевны на тему "TRANSPLASTOMIC TOBACCO LINES CONTAINING uidA REPORTER GENE UNDER CONTROL OF DIFFERENT PROMOTER SEQUENCES", в соавторстве с сотрудниками лаборатории систем биосинтеза природных соединений и отдела генетической инженерии Рудасом В.А., Герасименко И.М., Шелудько Ю.В., Василенко М.Ю., Кучуком Н.В., а также сотрудником компании DuPont Pioneer AgBiotech Теодором Кляйном (Klein T.M.) занял первое место на X Международной научной конференции студентов и аспирантов <<YOUTH AND PROGRESS OF BIOLOGY>> (Львов, 8–11 апреля 2014) на секции GENETICS AND BIOTECHNOLOGY. Тезисы конференции здесь
- 07.04.2014
Доклад Пироговского А.С. по работе "Розробка та апробація програмного забезпечення для конструювання синтетичних промоторів для регульованої експресії трансгенів у рослинах.(Разработка и апробация программного обеспечения для конструирования синтетических промоторов для регулируемой экспрессии трансгенов в растениях", выполненной под руководством и в соавторстве с сотрудниками лаборатории систем биосинтеза природных соединений отдела генетической инженерии Арбузовой И.А., Герасименко И.М. и Шелудько Ю.В. занял первое место на XІІ Международной научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых <<ШЕВЧЕНКОВСКАЯ ВЕСНА 2014: БИОЛОГИЧЕСКИЕ НАУКИ>>.
В издательстве Springer в 2013 вышла книга Biotechnology for Medicinal Plants: Micropropagation and Improvement, в которую вошла обзорная статья Biosynthetic Potential of Hairy Roots for Production of New Natural Productsсотрудников Лаборатории Шелудько Ю.В. и Герасименко И.М..В публикации фокусируется внимание на новых соединениях, изолированных из культур hairy roots, появление которых в трансгенных корнях обусловлено особенностями их физиологии, экзогенными стимулами или генноинженерными манипуляциями. Описываются примеры новых вторичных метаболитов, не обнаруженных в родительских растениях, а также продуктов экспрессии чужеродных генов. Авторы показывают, что трансгенные корни hairy roots могут рассматриваться как перспективный источник биоразнообразия природных соединений.
Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
Основные_направления работы:
- 1. Разработка платформы для высокоэффективной экспресси рекомбинантных белков в растениях.
Растительные экспрессионные системы могут служить источником биологически-активных белковых продуктов или использоваться как съедобные вакцины.
Разработка генноинженерной платформы для высокоэффективной экспрессии рекомбинантных белков в растениях включает ряд этапов:
Селекция и клонирование растительных регуляторных и транспортных элементов для конститутивной, тканеспецифической и индуцибельной экспрессии трансгенов и компартментализации белкового продукта. Создание коллекции регуляторных и транспортных генетических элементов.
Интеграция клонированых последовательностей в оптимизированные вектора для Agrobacterium-опосредованной трансформации растений.
Анализ полученных конструкций методом транзиентной экспресси в растениях. Agrobacterium-опосредствованная транзиентная экспрессия чужеродных генов в растениях дает возможность быстро получать рекомбинантные белки. В лаборатории разработана методика эффективной транзиентной экспрессии генов in planta, проведен отбор видов растений, наиболее пригодных для транзиентной экспрессии рекомбинантных белков, изучаются факторы, влияющие на эффективность транзиентной экспрессии.
Проведение Agrobacterium-опосредованной генетическая трансформации эксплантов модельных и сельскохозяйственных видов растений. Селекция трансформантов и анализ присутствия трансгенов методами мультиплексного ПЦР-анализа.
Анализ присутствия белкового продукта в трансгенных линия методом вестерн-блоттинга. Экстракция и анализ активности рекомбинантных белков.
- 2. Создание экспрессионно-селекционной системы, которая включает гибридный ген целевого и репортерного белка термостабильной лихеназы Clostridium thermocellum.
В большинстве случаев показано отсутствие влияния репортера на физиологическую активность слитого с ним целевого белка, а определение собственной активности репортера проводится при 70 оС после температурной денатурации ферментов растения, что обеспечивает высокую специфичность реакции. Использование данной системы позволяет одновременно с накоплением целевого продукта проводить мониторинг его количества, кроме того часто наблюдается увеличение стабильности гибридного продукта.
- 3. Изучение физиологической роли генов, кодирующих десатуразы с различной субстратной специфичностью, в жизнедеятельности растений в норме и при воздействии абиотических стрессовых факторов среды.
Изучение механизмов устойчивости растений к неблагоприятным условиям окружающей среды, а также создание растений, устойчивых к абиотическим стрессовым факторам, за счет экспрессии генов, контролирующих модификацию жирных кислот мембранных липидов. Впервые для создания экспериментальных моделей трансгенных растений использована стратегия переноса и экспрессии в растениях гибридных генов, в которых последовательность целевого гена имеет трансляционное слияние с последовательностью репортерного гена термостабильной лихеназы.
- 4. Исследование биохимических путей вторичного метаболизма. Разаработка ВЭЖХ систем для разделения низкомолекулярных соединений разных классов.
Мониторинг изменений спектра вторичных метаболитов в результате элиситации и стресса с использованием методов ВЭЖХ. Фракционирование экстрактов, изоляция и идентификация отдельных соединений.
Приборная база
Недавние публикации:
- Gerasymenko I.M., Mazur M.G., Sheludko Y.V., Kuchuk N.V. (2015) Multiplex pcr assay for detection of human somatotropin and interferon alpha2b genes in plant material Cytol. Genet., 49(3), 147-151 DOI: 10.3103/S0095452715030068) Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
- Gerasymenko I.M., Sakhno L.O., Kyrpa T.М., Ostapchuk A.N., Khadjiev T.A., Goldenkova-Pavlova I.V., Sheludko Y.V. (2015) Characterization of Nicotiana tabacum plants expressing hybrid genes of cyanobacterial Δ9 or Δ12 acyl–lipid desaturases and thermostable lichenase. Russian J. Plant Physiol. 62(3), 283-291.Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
- Sakhno L.O., Slyvets M.S., Korol N.A., Karbovska N.V., Ostapchuk A.M., SheludkoY.V., Kuchuk M.V. (2014) Changes in fatty acid composition in leaf lipids of canola biotech plants under short-time heat stress. J. Stress Physiol. Biochem., 10(2), 24-34.Full text download
- Sindarovska Y.R., Golovach I.S., Belokurova V.B., Gerasymenko I.M., Sheludko Y.V., Kuchuk N.V. (2014) Screening of plant cell culture collection for efficient host species for Agrobacterium-mediated transient expression. Cytol. Genet. 48(4), 208-217.
- Сливец М.С., Сахно Л.А., Шелудько Ю.В. Экспрессия трансгена desC цианобактерии в растениях рапса не изменяет их холодоусто йчивости (2013) Вісн. Укр. тов-ва генетиків і селекціонері 11(2), 267-275.Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
- Sheludko Y.V. , Gerasymenko I.M. (2013) Biosynthetic potential of hairy roots for production of new natural products. In: "Biotechnology for Medicinal Plants: Micropropagation and Improvement" Eds. Suman Chandra, Hemant Lata and Ajit Varma, Springer, Berlin, Heidelberg, 241-262. DOI: 10.1007/978-3-642-29974-2_10. Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
- Sindarovska Y. R., Gerasymenko I. M., Kuchuk M. V., Sheludko Y. V. (2012) Influence of exogenous phytohormones, methyl jasmonate and suppressors of jasmonate biosynthesis on Agrobacterium-mediated transient expression in Nicotiana excelsior. Biopolym. Cell., 28(№5), 368-373.fulltext Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
- Сахно Л.А., Герасименко И.М., Комарницкий И.К., Шелудько Ю.В., Голденкова-Павлова И.В. (2012) Создание устойчивых к глифосату растений Brassica napus L., экспрессирующих десатуразу DesC цианобактерии Synechococcus vulcanus. Biopolym. Cell., 28(6), 449-455. abstract Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
- Вячеславова А.О., Мустафаев О.Н., Тюрин А.А., Шимшилашвили Х.Р., Бердичевец И.Н., Шаяхметова Д.М., Голденков М.А., Фадеев В.С., Шелудько Ю.В., Голденкова-Павлова И. В. (2012) Серия модульных векторов для стабильной и транзиентной экспрессии гетерологичных генов в растениях. Генетика, 48(№9), 1046-1056. abstract. Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
- Gerasymenko I.M., Sakhno L.O., Mazur M.G., Sheludko Y.V. (2012) Multiplex PCR assay for detection of human interferon alpha2b gene in transgenic plants. Cytology and Genetics 46 (N4), 197-201.DOI: 10.3103/S009545271204007X Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
- Yu. Luchakivskaya, O. Kishchenko, I. Gerasymenko, Z. Olevinskaya, Yu. Simonenko, M. Spivak and M. Kuchuk (2011) High-level expression of human interferon alpha-2b in transgenic carrot (Daucus carota L.) plants. Plant Cell Reports DOI: 10.1007/s00299-010-0942-5
- Ovcharenko, O., V. Momot, N. Cherep, Y. Sheludko, I. Komarnitsky, V. Rudas and N. Kuchuk (2011) Transfer of transformed Lesquerella fendleri (Gray) Wats. chloroplasts into Orychophragmus violaceus (L.) O.E. Schulz by protoplast fusion." Plant Cell, Tissue and Organ Culture: 105, 21-27 doi.org/10.1007/s11240-010-9833-2
- Sindarovska Y.R., Gerasymenko I.M, Sheludko Y.V., Olevinskaja Z.M., Spivak N.Y., Kuchuk N.V. (2010) Production of human interferon alpha 2b in plants of Nicotiana excelsior by Agrobacterium-mediated transient expression. Cytol Genet 44 (N5), 313-316
- Berdichevets, I., H. Shimshilashvili, I. Gerasymenko, Y. Sindarovska, Y. Sheludko and I. Goldenkova-Pavlova (2010) Multiplex PCR assay for detection of recombinant genes encoding fatty acid desaturases fused with lichenase reporter protein in GM plants. Analytical and Bioanalytical Chemistry 397, 2289-2293DOI 10.1007/s00216-010-3770-0.
- Lystvan, K., V. Belokurova, Y. Sheludko, J. Ingham, V. Prykhodko, O. Kishchenko, E. Paton and M. Kuchuk (2010) Production of bakuchiol by in vitro systems of Psoralea drupacea Bge. Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC) 101, 99-103.
- Sheludko Y. V., (2010) Recent advances in plant biotechnology and genetic engineering for obtaining of secondary metabolites. Cytol Genet 44 (N1), 52-60.
- Герасименко И. М., Головач И. С., Кищенко Е. М., Сахно Л. А., Синдаровская Я. Р., Шимшилашвили Х. Р., Шелудько Ю.В., Голденкова-Павлова И.В. (2010) Получение и анализ трансгенных растений, несущих гены 9 и 12 десатураз цианобактерий. Информационный вестник ВОГиС 14 (1), 127-133.
Патенты лаборатории:
- Пат. 51842 Україна, МПК C 12 N 15/00, C 12 Q 1/25, C 12 Q 1/68. Спосiб детекції рекомбiнантного гена ацил-лiпlдної десатурази, злитої з термостабiльною лiхеназою, в генетично модифiкованiй рослинi методом мультиплексної полiмеразної ланцюгової реакції / Герасименко І.М., Сіндаровська Я.Р., Шелудько Ю.В., Бердічєвєць І. Н., Шімшілашвілі Х. Р., Голдєнкова-Павлова І.В.; заявник та патентовласник Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАНУ та Інстітут общєй гєнєтікі ім. Н. І. Вавілова РАН. –заявл. 23.11.09, заявка № u 2009 12102; заявл. 25.11.2009; опубл. 10.08.2010, Бюл. № 15.
- Пат. 31239 Україна, МПК A 01 H 5/00, A 01 H 5/12, C 07 K 14/00, C 12 N 15/63, C 12 N 15/84, C 12 P 21/00. Спосіб одержання рекомбінантного білка шляхом транзієнтної експресії трансгену в рослині виду Nicotiana excelsior / Сіндаровська Я.Р., Шелудько Ю.В., Герасименко І.М., Кучук М.В.; заявник та патентовласник Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАНУ. – № u 2007 14867; заявл. 27.12.07; опубл. 25.03.08, Бюл. № 6.