Оновлено ppdb: plant promoter database до версії 3.0

Матеріал з ІКБГІ
Версія від 23:52, 6 січня 2015; WikiSysop (обговореннявнесок)

(різн.) ← Попередня версія • Поточна версія (різн.) • Новіша версія → (різн.)
Перейти до: навігація, пошук

ppdb (plant promoter database) база даних рослинних промоторів, яка містить інформацію про сайти початку транскрипції (TSS), промоторні структури (TATA бокси, ініциатори, Y патчі, GA і CA елементи) та групи регуляторних елементів (REG) була оновлена до версії 3.0.

  • були вкючені нові генотипи і тепер в базі є
    • Arabidopsis thaliana,
    • рис,
    • Physcomitrella patens',
    • тополя
  • кількість TSS сайтів A. thaliana збільшено в 200 раз до 34 млн (порівняно з версією 1.0)
  • додано анотації про імовірне фізіологічне призначення REG елементів

Сайт бази даних

http://ppdb.agr.gifu-u.ac.jp

Джерела

Особисті інструменти
Простори назв

Варіанти
Дії
 
   
Інструменти