Лаборатория систем биосинтеза природных соединений

Материал из ИКБГИ
Перейти к: навигация, поиск

Содержание

Лаборатория образована в 2009 году

Презентация лаборатории

Состав:

Зав. лабораторией, к.б.н., с.н.с. Шелудько Юрий Всеволодович
н.с., к.б.н. Герасименко Ирина Михайловна
н.с., к.б.н. Синдаровская Яна Рудольфовна
ведущий инженер Мазур Мария Григорьевна
аспирант, инженер 1 кат.(1/2 ставки) Кирпа Татьяна Николаевна
Студентка-дипломница НТУУ КПИ, инженер 1 кат.(1/2 ставки) Арбузова Ирина Андреевна

Новости:

  • 07.04.2014
ШВ 2014м.jpg

Доклад Пироговского А.С. по работе "Розробка та апробація програмного забезпечення для конструювання синтетичних промоторів для регульованої експресії трансгенів у рослинах.(Разработка и апробация программного обеспечения для конструирования синтетических промоторов для регулируемой экспрессии трансгенов в растениях", выполненной под руководством и в соавторстве с сотрудниками лаборатории систем биосинтеза природных соединений отдела генетической инженерии Арбузовой И.А., Герасименко И.М. и Шелудько Ю.В. занял первое место на XІІ Международной научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых <<ШЕВЧЕНКОВСКАЯ ВЕСНА 2014: БИОЛОГИЧЕСКИЕ НАУКИ>>.
Доклад Дудак Д. А.<B/> по работе "Вивчення впливу екстрактів трансгенних рослин ріпаку на бактерії кишкової мікрофлори людини (Изучения влияния экстрактов трансгенных растений рапса на бактерии кишечной микрофлоры человека)" выполненной под руководством и в соавторстве с Кареевой М.А., а также сотрудником лаборатории систем биосинтеза природных соединений отдела генетической инженерии Герасименко И.М. и сотрудником отдела генетической инженерии Сахно Л.А. <B>занял третье место.

  • 30.09.2013
Alushta 2013a.jpg
Alushta 2013b.jpg

Сотрудники лаборатории систем биосинтеза природных соединений приняли активное участие в работе VIII Международной научной конференции «Факторы экспериментальной эволюции организмов», которая проходила в г. Алушта 23-27 сентября 2013 г. Доклад сотрудницы лаборатории систем биосинтеза природных соединений отдела генетической инженерии Герасименко И.М. "Гетерологические транзитные пептиды обеспечивают импорт репортерного белка в хлоропласты с разной эффективностью" был отмечен как лучший секционный доклад. Также был отмечен доклад сотрудницы лаборатории систем биосинтеза природных соединений отдела генетической инженерии Кирпы Т.Н. с соавт. "Гетрологическая экспрессия Δ9-ацил-липидной десатуразы цианобактерии в орхидее Dendrobium linguella Rchb. F" Подробнее

  • 29.04.2013
2013 Puschino Kirpa.jpg

Постерный доклад сотрудницы лаборатории Кирпы Т.Н. с соавт. "ОСОБЕННОСТИ ЖИРНОКИСЛОТНОГО СОСТАВА МЕМБРАННЫХ ЛИПИДОВ РАСТЕНИЙ NICOTIANA TABACUM, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ГЕНЫ D9 И D12 АЦИЛ-ЛИПИДНЫХ ДЕСАТУРАЗ ЦИАНОБАКТЕРИЙ" отмечен как лучший секционный доклад и награждён почётным дипломом 17-ой Международной пущинской школы-конференции молодых ученых «Биология – наука XXI века»

2012 springer Shel.jpg

В издательстве Springer в 2012 вышла книга Biotechnology for Medicinal Plants: Micropropagation and Improvement, в которую вошла обзорная статья Biosynthetic Potential of Hairy Roots for Production of New Natural Productsсотрудников Лаборатории Шелудько Ю.В. и Герасименко И.М..В публикации фокусируется внимание на новых соединениях, изолированных из культур hairy roots, появление которых в трансгенных корнях обусловлено особенностями их физиологии, экзогенными стимулами или генноинженерными манипуляциями. Описываются примеры новых вторичных метаболитов, не обнаруженных в родительских растениях, а также продуктов экспрессии чужеродных генов. Авторы показывают, что трансгенные корни hairy roots могут рассматриваться как перспективный источник биоразнообразия природных соединений.
Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.

Президент Украины Виктор Фёдорович Янукович вручает премию сотруднице лаборатории систем биосинтеза природных соединений Синдаровской Яне Рудольфовне

20.04.2012 Президент Украины Виктор Фёдорович Янукович торжественно вручил дипломы лауреатов ежегодной премии Президента Украины для молодых ученых 2011 года сотруднице лаборатории систем биосинтеза природных соединений отдела генетической инженерии Синдаровской Яне Рудольфовне и сотруднику отдела генетической инженерии Василенко Максиму Юрьевичу, а также коллегам из Института Микробиологии и вирусологии им. Д.К. Заболотного Лозовой Ольге Иосиповне и Демченко Александру Анатолиевичу за работу "Получение фармацевтически-ценных белков в растениях и изучение стойкости трансгенных растений к фитопатогенным вирусам". Фотоальбом церемонии здесь

Сотрудничество:

  • Институт физиологии им. А.А. Богомольца
  • Институт физиологии растений им. К.А.Тимирязева РАН, Москва
  • Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН, Лаборатория биоинженерии растений, Новосибирск
  • Институт микробиологии и вирусологии им. Д.К. Заболотного НАН Украины, Киев
  • Национальный институт винограда и вина "Магарач" УААН, Ялта
  • Институт проблем криобиологии и криомедицины НАН Украины, Харьков


Основные_направления работы:

  • 1. Разработка платформы для высокоэффективной экспресси рекомбинантных белков в растениях.

Растительные экспрессионные системы могут служить источником биологически-активных белковых продуктов или использоваться как съедобные вакцины.

Разработка генноинженерной платформы для высокоэффективной экспрессии рекомбинантных белков в растениях включает ряд этапов:

Селекция и клонирование растительных регуляторных и транспортных элементов для конститутивной, тканеспецифической и индуцибельной экспрессии трансгенов и компартментализации белкового продукта. Создание коллекции регуляторных и транспортных генетических элементов.

Интеграция клонированых последовательностей в оптимизированные вектора для Agrobacterium-опосредованной трансформации растений.

Анализ полученных конструкций методом транзиентной экспресси в растениях. Agrobacterium-опосредствованная транзиентная экспрессия чужеродных генов в растениях дает возможность быстро получать рекомбинантные белки. В лаборатории разработана методика эффективной транзиентной экспрессии генов in planta, проведен отбор видов растений, наиболее пригодных для транзиентной экспрессии рекомбинантных белков, изучаются факторы, влияющие на эффективность транзиентной экспрессии.

Проведение Agrobacterium-опосредованной генетическая трансформации эксплантов модельных и сельскохозяйственных видов растений. Селекция трансформантов и анализ присутствия трансгенов методами мультиплексного ПЦР-анализа.

Анализ присутствия белкового продукта в трансгенных линия методом вестерн-блоттинга. Экстракция и анализ активности рекомбинантных белков.

Публикации по теме 1...

  • 2. Создание экспрессионно-селекционной системы, которая включает гибридный ген целевого и репортерного белка термостабильной лихеназы Clostridium thermocellum.

В большинстве случаев показано отсутствие влияния репортера на физиологическую активность слитого с ним целевого белка, а определение собственной активности репортера проводится при 70 оС после температурной денатурации ферментов растения, что обеспечивает высокую специфичность реакции. Использование данной системы позволяет одновременно с накоплением целевого продукта проводить мониторинг его количества, кроме того часто наблюдается увеличение стабильности гибридного продукта.

Публикации по теме 2...

  • 3. Изучение физиологической роли генов, кодирующих десатуразы с различной субстратной специфичностью, в жизнедеятельности растений в норме и при воздействии абиотических стрессовых факторов среды.

Изучение механизмов устойчивости растений к неблагоприятным условиям окружающей среды, а также создание растений, устойчивых к абиотическим стрессовым факторам, за счет экспрессии генов, контролирующих модификацию жирных кислот мембранных липидов. Впервые для создания экспериментальных моделей трансгенных растений использована стратегия переноса и экспрессии в растениях гибридных генов, в которых последовательность целевого гена имеет трансляционное слияние с последовательностью репортерного гена термостабильной лихеназы.

Публикации по теме 3...

  • 4. Исследование биохимических путей вторичного метаболизма. Разаработка ВЭЖХ систем для разделения низкомолекулярных соединений разных классов.

Мониторинг изменений спектра вторичных метаболитов в результате элиситации и стресса с использованием методов ВЭЖХ. Фракционирование экстрактов, изоляция и идентификация отдельных соединений.

Публикации по теме 4...

Приборная база

Недавние публикации:

  • Sindarovska Y.R., Golovach I.S., Belokurova V.B., Gerasymenko I.M., Sheludko Y.V., Kuchuk N.V. (2014) Screening of plant cell culture collection for efficient host species for Agrobacterium-mediated transient expression. Cytol. Genet. 48(4), 9-18.
  • Sheludko Y.V. , Gerasymenko I.M. (2012) Biosynthetic potential of hairy roots for production of new natural products. In: "Biotechnology for Medicinal Plants: Micropropagation and Improvement" Eds. Suman Chandra, Hemant Lata and Ajit Varma, Springer, Berlin, Heidelberg, 241-262. DOI: 10.1007/978-3-642-29974-2_10. Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
  • Sindarovska Y. R., Gerasymenko I. M., Kuchuk M. V., Sheludko Y. V. (2012) Influence of exogenous phytohormones, methyl jasmonate and suppressors of jasmonate biosynthesis on Agrobacterium-mediated transient expression in Nicotiana excelsior. Biopolym. Cell., 28(№5), 368-373.fulltext Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
  • Сахно Л.А., Герасименко И.М., Комарницкий И.К., Шелудько Ю.В., Голденкова-Павлова И.В. (2012) Создание устойчивых к глифосату растений Brassica napus L., экспрессирующих десатуразу DesC цианобактерии Synechococcus vulcanus. Biopolym. Cell., 28(6), 449-455. abstract Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
  • Вячеславова А.О., Мустафаев О.Н., Тюрин А.А., Шимшилашвили Х.Р., Бердичевец И.Н., Шаяхметова Д.М., Голденков М.А., Фадеев В.С., Шелудько Ю.В., Голденкова-Павлова И. В. (2012) Серия модульных векторов для стабильной и транзиентной экспрессии гетерологичных генов в растениях. Генетика, 48(№9), 1046-1056. abstract. Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
  • Gerasymenko I.M., Sakhno L.O., Mazur M.G., Sheludko Y.V. (2012) Multiplex PCR assay for detection of human interferon alpha2b gene in transgenic plants. Cytology and Genetics 46 (N4), 197-201.DOI: 10.3103/S009545271204007X Request/Запросить копию у автора: ysheludko@ukr.net.
  • Yu. Luchakivskaya, O. Kishchenko, I. Gerasymenko, Z. Olevinskaya, Yu. Simonenko, M. Spivak and M. Kuchuk (2011) High-level expression of human interferon alpha-2b in transgenic carrot (Daucus carota L.) plants. Plant Cell Reports DOI: 10.1007/s00299-010-0942-5
  • Ovcharenko, O., V. Momot, N. Cherep, Y. Sheludko, I. Komarnitsky, V. Rudas and N. Kuchuk (2011) Transfer of transformed Lesquerella fendleri (Gray) Wats. chloroplasts into Orychophragmus violaceus (L.) O.E. Schulz by protoplast fusion." Plant Cell, Tissue and Organ Culture: 105, 21-27 doi.org/10.1007/s11240-010-9833-2
  • Sindarovska Y.R., Gerasymenko I.M, Sheludko Y.V., Olevinskaja Z.M., Spivak N.Y., Kuchuk N.V. (2010) Production of human interferon alpha 2b in plants of Nicotiana excelsior by Agrobacterium-mediated transient expression. Cytol Genet 44 (N5), 313-316
  • Berdichevets, I., H. Shimshilashvili, I. Gerasymenko, Y. Sindarovska, Y. Sheludko and I. Goldenkova-Pavlova (2010) Multiplex PCR assay for detection of recombinant genes encoding fatty acid desaturases fused with lichenase reporter protein in GM plants. Analytical and Bioanalytical Chemistry 397, 2289-2293DOI 10.1007/s00216-010-3770-0.
  • Lystvan, K., V. Belokurova, Y. Sheludko, J. Ingham, V. Prykhodko, O. Kishchenko, E. Paton and M. Kuchuk (2010) Production of bakuchiol by in vitro systems of Psoralea drupacea Bge. Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC) 101, 99-103.
  • Sheludko Y. V., (2010) Recent advances in plant biotechnology and genetic engineering for obtaining of secondary metabolites. Cytol Genet 44 (N1), 52-60.
  • Герасименко И. М., Головач И. С., Кищенко Е. М., Сахно Л. А., Синдаровская Я. Р., Шимшилашвили Х. Р., Шелудько Ю.В., Голденкова-Павлова И.В. (2010) Получение и анализ трансгенных растений, несущих гены 9 и 12 десатураз цианобактерий. Информационный вестник ВОГиС 14 (1), 127-133.

Патенты лаборатории:

  • Пат. 51842 Україна, МПК C 12 N 15/00, C 12 Q 1/25, C 12 Q 1/68. Спосiб детекції рекомбiнантного гена ацил-лiпlдної десатурази, злитої з термостабiльною лiхеназою, в генетично модифiкованiй рослинi методом мультиплексної полiмеразної ланцюгової реакції / Герасименко І.М., Сіндаровська Я.Р., Шелудько Ю.В., Бердічєвєць І. Н., Шімшілашвілі Х. Р., Голдєнкова-Павлова І.В.; заявник та патентовласник Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАНУ та Інстітут общєй гєнєтікі ім. Н. І. Вавілова РАН. –заявл. 23.11.09, заявка № u 2009 12102; заявл. 25.11.2009; опубл. 10.08.2010, Бюл. № 15.
  • 21. Пат. 31239 Україна, МПК A 01 H 5/00, A 01 H 5/12, C 07 K 14/00, C 12 N 15/63, C 12 N 15/84, C 12 P 21/00. Спосіб одержання рекомбінантного білка шляхом транзієнтної експресії трансгену в рослині виду Nicotiana excelsior / Сіндаровська Я.Р., Шелудько Ю.В., Герасименко І.М., Кучук М.В.; заявник та патентовласник Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАНУ. – № u 2007 14867; заявл. 27.12.07; опубл. 25.03.08, Бюл. № 6.
Персональные инструменты
На других языках